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Les modèles de Markov sont utilisés de manière importante mais pourtant, en sciences biologiques, cette puissante technique est laissée de coté depuis trop longtemps. Est-ce parce que traditionnement les biologistes reçoivent des formations non-mathématiques ou serait-ce parce les applications biologiques du modèle de Markov sont trop peu connues ? Cette histoire d'oeuf et de poule vient enfin de voir éclore une solution grâce au nouveau modèle-jouet du chercheur Eddy. Il est question dans ce document d'un atelier d'apprentissage des modèles de Markov à travers une application biologique. C'est le modèle de Eddy qui sert de patron de base à nos exercices.